डी-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम और एल-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम एनैन्टीओमर हैं, जिसका अर्थ है कि वे एक दूसरे की दर्पण छवियां हैं और परमाणुओं की अलग-अलग स्थानिक व्यवस्था है। डी-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम को एल-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम से अलग करने में आमतौर पर चिरल पृथक्करण तकनीक शामिल होती है। इस तरह के पृथक्करण के लिए उपयोग की जाने वाली दो सामान्य विधियाँ यहां दी गई हैं:
चिरल क्रोमैटोग्राफी: चिरल क्रोमैटोग्राफी एनैन्टीओमेरिक पृथक्करण के लिए एक व्यापक रूप से नियोजित तकनीक है। इसमें एक चिरल स्थिर चरण का उपयोग शामिल है, जो एक स्तंभ या राल है जिसमें चिरल चयनकर्ता होता है। चिरल चयनकर्ता एनैन्टीओमर्स के साथ अलग-अलग तरह से इंटरैक्ट करता है, जिससे उनका अलग-अलग प्रतिधारण और पृथक्करण होता है। स्तंभ को चिरल स्थिर चरण के साथ पैक किया जाता है, और डी-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम और एल-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम का मिश्रण विशिष्ट मोबाइल चरण स्थितियों के तहत स्तंभ के माध्यम से पारित किया जाता है। जैसे ही यौगिक स्तंभ से गुजरते हैं, वे चिरल स्थिर चरण के साथ अलग-अलग तरीके से बातचीत करते हैं, जिसके परिणामस्वरूप एनैन्टीओमर्स अलग हो जाते हैं।
एंजाइमैटिक रिज़ॉल्यूशन: एंजाइमैटिक रिज़ॉल्यूशन एक अन्य विधि है जिसका उपयोग एनैन्टीओमर्स को अलग करने के लिए किया जाता है। इसमें एंजाइमों का उपयोग शामिल है जो चुनिंदा रूप से एक एनैन्टीओमर के साथ बातचीत करते हैं, इसे एक उत्पाद में परिवर्तित करते हैं जबकि दूसरे एनैन्टीओमर को अप्रभावित छोड़ देते हैं। उदाहरण के लिए, एक एंजाइम चुनिंदा रूप से डी-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम के साथ प्रतिक्रिया उत्प्रेरित कर सकता है लेकिन एल-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम के साथ नहीं। प्रतिक्रियाशीलता में इस अंतर का उपयोग करके, दो एनैन्टीओमर्स को अलग किया जा सकता है। एंजाइमैटिक रिज़ॉल्यूशन को समाधान में या ठोस समर्थन पर स्थिर एंजाइमों के माध्यम से किया जा सकता है।
यह ध्यान रखना महत्वपूर्ण है कि नियोजित विशिष्ट पृथक्करण विधि एनैन्टीओमर्स के गुणों, अलग किए गए एनैन्टीओमर की वांछित शुद्धता और उचित पृथक्करण तकनीकों की उपलब्धता जैसे कारकों पर निर्भर हो सकती है। इसके अतिरिक्त, डी-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम और एल-क्लोप्रोस्टेनॉल सोडियम का पृथक्करण दवा निर्माताओं द्वारा किया जा सकता है और इसमें उनकी विनिर्माण प्रक्रियाओं के लिए विशिष्ट स्वामित्व प्रक्रियाएं शामिल हो सकती हैं।